「技術」の記事一覧

新規ろ過・抽出法（BC法）と学会法の総合比較

最近開発された微細流路を使用したろ過・抽出法（ビリューチップ法orBC法；参照論文）は図－１に示すような流路チップを使用して、環境DNA測定の前処理がでる今までにない方法です。そこでこのBC法の性能（ろ過＆抽出効率）をこ […]

1.はじめに　今回は今後環境DNA測定に役立つと思われる論文（http://doi.org/10.1002/edn3.406）の紹介になります。　環境DNA学会のマニュアルに記載されているキアゲン（Qiagen）社の […]

　以前の投稿で、環境水に含まれる夾雑物によってPCR阻害のみならず抽出阻害も発生することを実験データと共に示しました。PCR阻害はPCR前に標準物質を入れること、もしくは抽出液を薄めることで阻害の有無とその程度を推測でき […]

　新型コロナ蔓延に際して、これまでごく一部の研究者にしか知られていなかったPCRが一躍メジャーな言葉になりました。しかし実際にPCRをしようと思うと大型で高価なPCR装置を入手する必要があり専門機関でしができないと考えて […]

　環境DNAの検出を行う場合、多くの場合なるべく高濃度の抽出液を得たいと思うはずです。ここでは高濃度に抽出するためのヒントになるデータがありますので紹介します。　学会のマニュアルに記載されているキアゲン社キット(DNe […]

　環境水を出発点とする環境DNAの検出では、夾雑物による阻害の影響を常に考えなければなりません。環境DNA学会が発行するマニュアルや環境DNAのバイブル本（？勝手にそう思っていますが「環境DNA」共立出版発行のもの）など […]

　先の投稿「水質による環境DNA測定結果の変動について(1)」で環境DNA学会のマニュアルにある方法で測定した場合でも、環境水の水質により測定データが一桁以上ばらつく可能性があるということを説明しました。またこのバラツキ […]

　環境DNA学会のマニュアルにあるキアゲン抽出法（学会法）とこのサイトで紹介している簡易抽出法の比較は、効率比較（１）で簡単な効率比較の例を紹介しました。内容はコイのいる池の水をもちいて二つの方法で抽出し、増幅曲線からC […]

　学会のマニュアルに従って抽出・PCR増幅を行ったとしても環境水の水質により測定結果が変動します。場合によっては一桁以上変わる可能性があることを実験データで示します。

コイのいる池の水をもちいてキアゲン法と簡易法で効率を比較しました。この実験の結果は簡易法の方が効率が良いと言うデータでした。