知ってて得する環境DNAワンポイント技術情報

新規ろ過・抽出法（BC法）と学会法の総合比較

最近開発された微細流路を使用したろ過・抽出法（ビリューチップ法orBC法；参照論文）は図－１に示すような流路チップを使用して、環境DNA測定の前処理がでる今までにない方法です。そこでこのBC法の性能（ろ過＆抽出効率）をこ […]

メタバーコディングする場合のフィルタリング量（ろ過量）と検出種数の関係はパシフィックコンサルタンツ(PCKK)さんが公開している資料が参考になります。この資料によると（キアゲン法で抽出した場合は）図－１のようにフィルタリ […]

最近開発したビリューチップを使用したろ過＆抽出法（ビリューチップ法/BC法）は、学会のマニュアルにあるキアゲン社のキットを使用した方法（学会法と呼んでます）と比べて圧倒的に手順は簡単で誰にでもできます。一方で簡単だけど […]

環境DNA測定に於いて、使用する機器（ここではバケツやフィルタリング器具等）に付着していたDNAが、一連の作業中に混入（コンタミ）することを避ける必要があります。さもないと本来いないはずの種がPCR（orメタバーコーディ […]

1.はじめに　今回は今後環境DNA測定に役立つと思われる論文（http://doi.org/10.1002/edn3.406）の紹介になります。　環境DNA学会のマニュアルに記載されているキアゲン（Qiagen）社の […]

　以前の投稿で、環境水に含まれる夾雑物によってPCR阻害のみならず抽出阻害も発生することを実験データと共に示しました。PCR阻害はPCR前に標準物質を入れること、もしくは抽出液を薄めることで阻害の有無とその程度を推測でき […]

　新型コロナ蔓延に際して、これまでごく一部の研究者にしか知られていなかったPCRが一躍メジャーな言葉になりました。しかし実際にPCRをしようと思うと大型で高価なPCR装置を入手する必要があり専門機関でしができないと考えて […]

　環境DNAの検出を行う場合、多くの場合なるべく高濃度の抽出液を得たいと思うはずです。ここでは高濃度に抽出するためのヒントになるデータがありますので紹介します。　学会のマニュアルに記載されているキアゲン社キット(DNe […]

　環境水を出発点とする環境DNAの検出では、夾雑物による阻害の影響を常に考えなければなりません。環境DNA学会が発行するマニュアルや環境DNAのバイブル本（？勝手にそう思っていますが「環境DNA」共立出版発行のもの）など […]

　先の投稿「水質による環境DNA測定結果の変動について(1)」で環境DNA学会のマニュアルにある方法で測定した場合でも、環境水の水質により測定データが一桁以上ばらつく可能性があるということを説明しました。またこのバラツキ […]