知ってて得する環境DNAワンポイント技術情報

　環境DNA以外の文献から環境DNAは生き物のどの部分から出たDNAかを考察しました。結論として魚の腸管細胞から来ていると思われます。

学会マニュアルではコンタミやキャリーオーバーを無くすためにハイターで洗浄するようにと書いています。しかし一方でハイター洗浄後の洗い流しをきっちりしないと感度が悪くなります。このことについて啓蒙しています。

　文献と実際に行ったテストの結果を合わせて環境DNAのサイズに関する考察しました。結論としてサイズは１～10umが主体であると思われます。

環境DNA調査時に、採水した水を持ち帰って測定する場合に添加する塩化ベンザルコニウム溶液（オスバン）の効果について説明します。

簡易抽出法（ＨＳ法）に於いて、抽出後の抽出液をステリベクスの注入口から取り出す場合と排出口から取り出す場合でＣｔ値を比較しました。結果は同じというデータになっています。

　学会マニュアルのキアゲン社抽出キットをもちいた抽出手順でミニローテータを使用していますが、この有用性とテストしてみた結果です。結果はあまり変わりませんでした。

　学会マニュアルでキアゲン社抽出キットをもちいた環境ＤＮＡ抽出を推奨していますが、このキットの手順についての技術的な背景を簡単に紹介しています。